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Micron Document

<!DOCTYPE html>

<title>Ti-Plasmid</title>

</head>

<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">Ti-Plasmid</span></h1>

</header>

</div>

<th colspan="2" style="background:#81BEF7; color:#000000;">Nukleinsäure

</th></tr>

<tr>

</td></tr>

<tr>

<th colspan="2" style="background:#81BEF7; color:#000000;">Allgemeines

</th></tr>

<tr>

<td style="width:33%;">Name

</td>

<td>Ti-Plasmid

</td></tr>

<tr>

<th colspan="2" style="background:#81BEF7; color:#000000;">Identifikatoren

</th></tr>

<tr>

<td><a href="GenBank" title="GenBank">GenBank</a>

</td>

</td></tr>

<tr>

<td><a href="RefSeq" class="mw-redirect" title="RefSeq">RefSeq</a> DNA

</td>

</td></tr>

<tr>

<th colspan="2" style="background:#81BEF7; color:#000000;">Eigenschaften

</th></tr>

<tr>

<td><a href="Taxon" title="Taxon">Taxon</a>

</td>

<td><span style="font-style:italic;"><i><a href="Agrobacterium_tumefaciens" title="Agrobacterium tumefaciens">Agrobacterium tumefaciens</a></i></span>

</td></tr></tbody></table><p><span class="editoronly" style="display:none;"></span>

</p><p><b>Tumor-induzierende Plasmide</b> (<span style="font-style:normal;font-weight:normal"><a href="Englische_Sprache" title="Englische Sprache">englisch</a></span> <span lang="en-Latn" style="font-style:italic"><b>T</b>umor <b>i</b>nducing <b>plasmid</b></span>) sind <a href="Plasmid" title="Plasmid">Plasmide</a>, die häufig, aber nicht immer, zur genetischen Ausstattung der Bakterienarten <i><a href="Agrobacterium_tumefaciens" title="Agrobacterium tumefaciens">Agrobacterium tumefaciens</a></i> und <i><a href="Agrobacterium_rhizogenes" class="mw-redirect" title="Agrobacterium rhizogenes">Agrobacterium rhizogenes</a></i> gehören.<br>

Die Gene des Ti-Plasmides ermöglichen es Agrobakterien, <a href="Desoxyribonukleins%C3%A4ure" title="Desoxyribonukleinsäure">DNA</a> in Pflanzenzellen zu übertragen und diese genetisch zu verändern. Sie lösen tumorartige Wucherungen und damit Pflanzenkrankheiten aus.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Gene_der_Ti-Plasmide">Gene der Ti-Plasmide</h2></div>

<p>Das Ti-Plasmid ist etwa 200 <a href="Kilobase" class="mw-redirect" title="Kilobase">kb</a> groß. Folgende Gruppen wichtiger Gene befinden sich auf dem Plasmid:

</p>

<ul><li>Transfer- oder <i>tra</i>-Gene</li>

<li>Virulenz- oder <i>vir</i>-Gene (beide notwendig für den DNA-Transfer in die Pflanzenzelle)</li>

<li>Gene für den Opinkatabolismus (notwendig für den Abbau von <a href="Opine" title="Opine">Opinen</a> durch das Bakterium)</li></ul>

<p>sowie die in die Pflanzenzelle übertragbare Transfer- oder t-DNA mit

</p>

<ul><li>Tumorgenese- oder <i>onc</i>-Genen (notwendig für die Tumorinduktion in der Pflanzenzelle, zum Beispiel <i>tms1</i>, <i>tms2</i> und <i>tmr</i>) sowie</li>

<li>Opinsynthese- oder <i>ops</i>-Genen (notwendig für die Synthese der Opine durch die Pflanzenzelle, zum Beispiel <i>nos</i> für die Nopalin-Synthese, <i>ocs</i> für die Octopin-Synthese usw.).</li></ul>

<p>Die t-DNA wird von imperfekten <a href="Tandemwiederholung" class="mw-redirect" title="Tandemwiederholung">Tandemwiederholungen</a> von 25 <a href="Nukleinbase" class="mw-redirect" title="Nukleinbase">Basen</a><sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> flankiert: "<i>left border</i>" (<b>LB</b>) und "<i>right border</i>" (<b>RB</b>) signalisieren den Vir-Proteinen Beginn und Ende der t-DNA. Diese <a href="Cis-Element" title="Cis-Element">cis-Elemente</a> sind essentiell für die Übertragung der t-DNA.<sup id="cite_ref-2" class="reference"><a href="#cite_note-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p><p>Das Plasmid verfügt außerdem über einen <a href="Replikation" title="Replikation">Replikationsursprung</a> (<i>ori</i> oder <i>origin of replication</i>) und weitere Regionen. Die Gene für die Erkennung der Pflanzenzellen und die Anheftung an diese befinden sich dagegen im bakteriellen <a href="Genom" title="Genom">Genom</a>.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Mechanismus_der_Genaktivierung_und_-übertragung"><span id="Mechanismus_der_Genaktivierung_und_-.C3.BCbertragung"></span>Mechanismus der Genaktivierung und -übertragung</h2></div>

<p><a href="Acetosyringon" title="Acetosyringon">Acetosyringon</a> und andere <a href="Phenol" title="Phenol">phenolische</a> Verbindungen, die aus verwundeten Pflanzenteilen austreten, aktivieren das Produkt des <i>vir</i>A-Genes, eine in der äußeren bakteriellen Zellmembran befindliche <a href="Histidinkinasen" title="Histidinkinasen">Sensorkinase</a>. Diese phosphoryliert und aktiviert das VirG-Protein. VirG ist ein <a href="Genregulation" title="Genregulation">Responseregulator</a>, und zwar ein Aktivator der anderen <i>vir</i>-Gene, deren <a href="Transkription_(Biologie)" title="Transkription (Biologie)">Transkriptionsrate</a> hiermit um ein Vielfaches ansteigt. Zu den nun transkribierten Genen gehören <i>vir</i>D, <i>vir</i>E und <i>vir</i>B.

VirD ist eine <a href="Endonuklease" title="Endonuklease">Endonuklease</a>. Das Protein verursacht am rechten <i>repeat</i>, der die t-DNA flankiert, einen Einzelstrangbruch. Hier beginnt die Synthese eines komplementären Stranges; der Einzelstrang wird dabei verdrängt. Dieser Mechanismus ähnelt der <i>rolling circle</i>-Replikation von Plasmiden, nur dass hier ein gerader Einzelstrang mit vorgegebenem Ende entsteht. VirE bindet und stabilisiert die einzelsträngige t-DNA und schützt diese vor dem Abbau. VirB befindet sich in der bakteriellen Zellmembran und gestattet durch direkten Kontakt mit der Pflanzenzelle die Übertragung der t-DNA. Darüber hinaus sind die Adhäsionsproteine chvA, chvB und pscA am t-DNA-Transfer beteiligt. Der Mechanismus der DNA-Übertragung ähnelt dem der bakteriellen <a href="Konjugation_(Biologie)" title="Konjugation (Biologie)">Konjugation</a>. Das VirD-Protein bleibt an der t-DNA gebunden und gelangt mit dieser in die Pflanzenzelle. Die übertragene t-DNA ist etwa 20 kb groß.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Integration_der_t-DNA">Integration der t-DNA</h2></div>

<p>Das VirE-Protein verfügt über eine <a href="Kernlokalisatiossequenz" class="mw-redirect" title="Kernlokalisatiossequenz">Kernlokalisatiossequenz</a> und wird nach dem Einschleusen in die Pflanzenzelle zusammen mit der ummantelten t-DNA entlang des <a href="Cytoskelett" title="Cytoskelett">Cytoskeletts</a> in den pflanzlichen Zellkern transportiert. Die Integration in das pflanzliche Genom erfolgt eher unspezifisch, wird jedoch durch bestimmte Tandemwiederholungen begünstigt.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Wirkung_der_t-DNA">Wirkung der t-DNA</h2></div>

<p>Die <i>onc</i>-Gene enthalten unter anderem die Gene für die Tryptophanmonooxygenase (Gen <i>iaaM</i>, wobei iaa für <i>indol-3-acetic acid</i> steht, das biologisch aktive Pflanzenhormon Auxin), Indolacetamidhydrolase (<i>iaaH</i>) und die Isopentenyltransferase (<i>itpZ</i>). Diese Enzyme stören den <a href="Hormon" title="Hormon">Hormonhaushalt</a> der Pflanze, indem eine zusätzliche Synthese der Phytohormone <a href="Auxin" class="mw-redirect" title="Auxin">Auxin</a> und <a href="Cytokinin" class="mw-redirect" title="Cytokinin">Cytokinin</a> induziert wird. Die Zellen beginnen sich zu teilen; die als „Gallen“ bezeichneten Wucherungen entstehen. Die durch Ti-Plasmide induzierten Tumore bestehen meist aus wenig oder nicht differenzierter <a href="Kallus_(Botanik)" title="Kallus (Botanik)">Kallusmasse</a>. Die durch das Ri-Plasmid von <i><a href="Rhizobium_rhizogenes" title="Rhizobium rhizogenes">Rhizobium rhizogenes</a></i> (früher: <i>Agrobacterium rhizogenes</i>) ausgelösten Wucherungen der Wurzeln stellen dagegen zumindest teilweise differenziertes Wurzelgewebe dar.

Die <i>ops</i>-Gene veranlassen die pflanzliche Zelle, stickstoffreiche Opine zu produzieren. Da die Gene für den Katabolismus (Abbau) der Opine nicht mit übertragen werden, steht den Bakterien so eine exklusive Energie- und Stickstoffquelle zur Verfügung. Interessant ist, dass die aus dem Bakterium stammenden Gene der t-DNA eine typisch eukaryotische Struktur aufweisen und in der Pflanzenzelle aktiv sind.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Gentechnische_Anwendung">Gentechnische Anwendung</h2></div>

<p>Die gentechnische Veränderung von Pflanzen ist vergleichsweise schwierig. Aus diesem Grunde wurde das natürliche System des Gentransfers in Pflanzenzellen intensiv erforscht und angewendet. Bei der <a href="Transformation_(Genetik)" title="Transformation (Genetik)">Transformation</a> von Pflanzen werden Ti-Plasmide verwendet, in denen die Gene für die Tumorbildung durch die gewünschten Gene ersetzt wurden. Die Zugabe von <a href="Nematoden" class="mw-redirect" title="Nematoden">Nematoden</a> bewirkt die Verletzung der Pflanzen auf zellulärer Ebene und ebnet den Weg für die Infektion durch Agrobakterien.

</p><p>Das System der Pflanzen-Transformation mit Hilfe von Agrobakterien wird erfolgreich zur Erforschung der pflanzlichen Genetik angewendet. Daneben wird es zur Herstellung kommerzieller gentechnisch veränderter Pflanzen genutzt. Beispiele sind

</p>

<li><a href="Flavr-Savr-Tomate" title="Flavr-Savr-Tomate">Flavr-Savr-Tomate</a> („Anti-Matsch-Tomate“)</li>

<li>herbizidresistentes Getreide</li></ul>

<p>und andere.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Binäre_Vektoren"><span id="Bin.C3.A4re_Vektoren"></span>Binäre Vektoren</h3></div>

<p>Um die Menge an fremden Genen, die auf die Pflanze übertragen werden, möglichst gering zu halten, nutzt man das System binärer Vektoren.

Binäre Vektoren sind das am meisten genutzte System bei der <i>A. tumefaciens</i> vermittelten Übertragung von Genen auf Pflanzen. Bei diesem System liegen im Bakterium zwei Plasmide vor. Ein entwaffnetes Ti-Plasmid, das die <i>vir</i>-Region trägt, dessen T-DNA-Region jedoch entfernt wurde; genannt ‚Helfer Ti-Plasmid‘. Außerdem ein Plasmid, das in einer T-DNA-Region das <i>gene of interest</i> trägt, welches übertragen werden soll.

Bei der Infektion von Pflanzen mit <i>A. tumefaciens</i>, welches die beiden Plasmide trägt, löst das Helfer Ti-Plasmid die Assoziation des Bakteriums mit der Pflanzenzelle aus. Anschließend wird die T-DNA des zweiten Plasmids vom Bakterium in das Pflanzengenom übertragen.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a></span> <span class="reference-text">Yadav, N. S. <i>et al</i>. (<b>1982</b>). <i>Short direct repeats flank the T-DNA on a nopaline Ti plasmid.</i> <a href="Proceedings_of_the_National_Academy_of_Sciences" class="mw-redirect" title="Proceedings of the National Academy of Sciences">Proceedings of the National Academy of Sciences</a>-Biological Sciences 79(20): 6322–6326, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16593241?dopt=Abstract">PMID 16593241</a>; <a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.pnas.org/content/79/20/6322.full.pdf+html">PDF</a> (freier Volltextzugriff, engl.)</span>

</li>

<li id="cite_note-2"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-2">↑</a></span> <span class="reference-text">Komori, T. <i>et al</i>. (<b>2007</b>). <i>Current status of binary vectors and superbinary vectors.</i> Plant Physiology 145(4): 1155–1160; <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18056865?dopt=Abstract">PMID 18056865</a>; <a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.plantphysiol.org/content/145/4/1155.full.pdf+html">PDF</a> (freier Volltextzugriff, engl.)</span>

</li>

</ol>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Literatur">Literatur</h2></div>

<ul><li>Frank Kempken und Renate Kempken: <i>Gentechnik bei Pflanzen: Chancen und Risiken</i>. Springer; 3., überarb. u. aktualisierte Auflage (2006); ISBN 978-3540336617</li>

<li>David Clark, Nanette Pazdernik, Andreas Held (Übersetzer): <i>Molekulare Biotechnologie: Grundlagen und Anwendungen</i>. Spektrum Akademischer Verlag 2009; ISBN 978-3827421289</li>

<li>P.C. Trivedi: <i>Plant Tissue Culture and Biotechnology</i> Jaipur 2006. ISBN 978-8171324477</li></ul></div><div><div class="zim-footer">

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